La sintaxis de la funcion Window.Open de Javascript tiene un parametro que es el nombre de la ventana
window.open (URL, windowName[, windowFeatures])
Entonces podes poner algo asi:
<input type="button" name="boton1" value="Test" onclick=" window.open ('http://www.google.com','mywindow');" />
De esa manera cada ves que den click intentan crear la ventana con el nombre mywindow y como ya esta abierta no abre otra.