si, hay discos duros con un solo plato y una sola cara, no hay nada que hacer.
pero si se tiene un plato y dos caras entonces se tienen 2 cabezales de lectura/escritura, seria mas facil para la electronica del disco que los datos esten alojados en una cara del disco bajo una sola particion a buscarlos primero en una cara y luego la siguiente, pero admito que de eso no se nada, solo son conjeturas mias.
de manera empirica, se puede probar a hacer los tamaños de las particiones, ejecutar una prueba como el HD Tach para ver si el tamaño beneficia el rendimiento del disco, creo que ni loco lo haria pues implica borrar el os a cada rato, y seria tedioso.