Como pasar una cadena de texto a md5
http://www.kbcafe.com/iBLOGthere4iM/?guid=20040923142406
ese ejemplo es para md5 es el primer resultado que te sale en google al poner md5 c# , si queres algun otro tipo de cifrado solalmente cambia md5 y pone el que andas buscando. si te bastan los 64bits usa ese
Otra manera y que es la que he usado en alguna ocasion es en el query de la base de datos poner la funcion que en la base de datos hace el cifrado por ejemplo SELECT + FROM USERS WHERE password=MD5(PASSWORD)