A ver si entiendo:
Tu usas un software para administracion y monitoreo remoto.
Pero hay cosas que no las puedes hacer porque no tienes privilegios de administrador.
Ahora bien, de esos software me acuerdo que muchos o no se si todos corren como servicio y la mayoria corren con la cuenta de "SYSTEM" de la pc local para tener acceso a varia informacion.
No se si tu software trabaja como el NAGIOS o ZABBIX para eso, que son para monitoreo de equipos y otras cositas como estadisticas y monitoreo de servicios.
No has pensado usar otras opciones como
Spiceworks que es gratis y tiene otras cositas como un sencillo helpdesk para llevar control de los casos reportados y que se instala un cliente en la pc y este se conecta a un server donde le envia toda la info.
Ojala te sirva,por ahi IBM da uno que viene con su equipo y puede ser usado en otros pero con limitantes se llama DIRECTOR.