Ya buscaste en San Google?
Mira lo que encontre:
Protege con contraseña tu dispositivo de memoria USBLock it Easy protege los datos que guardes en tu dispositivo de memoria USB de forma fácil, rápida y segura.
El programa incorpora una función similar a una herramienta para crear particiones con la que puedes decidir exactamente el porcentaje del USB que proteges y el que dejas libre. Después, sólo tienes que aplicar una contraseña y listo.
De esta manera puedes reservar una parte de tu USB para documentos privados a los que sólo tú puedes tener acceso.
Fuente:
http://descargas.terra.es/ie/46426-Lock-it-Easy