Si tu problema en si era ese del autorun... no hay ningun problema podes volver a colocar tu respaldo en tu usb... y para asegurate de ke ya no este andete opciones de carpeta-> ver archivos protegidos por el sistema... luego si todavia esta .. te aparecera ese autorun.inf como oculto.. y ahi le das en la neck... o si keres andar protegida tu usb de ese virus.... buscate aca en el foro un programa q se llama Elipen es una utilidad para evitar q tu usb se infecte con ese virus....!
Saludos.!