Los ejecutables de Windows pueden correr en Linux bajo Wine.. De Wine desciende Cedega (optimizado para juegos) y Crossover (Para Office y algunos programas más extrañados) estos últimos dos son comerciales.
Correr ejecutables de Windows es casi que innecesario, por cada programa en Windows hay 5 mejores en Linux.. Sólo en la ofimática estamos un poco retrasaditos con OpenOffice... Ojalá cambie con Lotus Symphony. Nada más mirá Amarok, K3B, Konqueror, y muchos más. No existen programas similares en Windows.
Ahh por supuesto, para los juegos, si ahi no hay para dónde... No vayás a virtualizar Windows porque no soporta aceleración gráfica, como quizás estarías más comodo sería con una pequeña partición con SuricataOS Extreme Gamming (un XP optimizado para gammers xD)
Saludoozzz!!