seria bueno ver el sitio, al flash le podes poner porcentaje, y el resto de imagenes depende como sean, tenes que ver la manera que una parte sea escalable por ejemplo con css si la imagen lleva un degradado podes hacer que se repita horizontalmente o verticalmente...
ahora respeto a si es mejor de una o de otra manera es cuestion de gustos, yo lo que te diria es que si la queres de ancho fijo le aumentes un poco mas el ancho, aun no se ha definido como un estandar pero hay mucha gente que ya usa 1024 y mayores resoluciones... no tardara en ser adoptada como la resolucion estandar, yo por ejemplo diseño anchos fijos de 900

y quedan bastante bien