Pues depende de la empresa, por que ya he visto anuncios que sólo quieren gente de tal universidad.
Ahora bien, según lo que he visto últimamente la mayoría de ofertas lo que piden es experiencia y que por lo menos tengas un tercer año de universidad(obviamente depende de la plaza también).
En cuanto a mi experiencia laboral(que no llevo mucho por cierto, unos cuantos meses) lo que he visto en Avianca que es dónde trabajo actualmente como programador, ellos no le dan tanta importancia al lugar de dónde has salido/estés estudiando, a ellos lo que les interesa es que pases todas las pruebas que te hacen, por eso ahí he visto gente de todos lados (UCA, UFG, UES, UDB y UTEC).