La verdad que por ese filtro no se puede aruinar el a/c, ese filtro solo sirve para limpiar el aire que viene del exterior, todos los carros traen un boton en el panel de control de A/C que sirve para recirculacion, osea si quieres que solo circule el aire de la cabina o si lo dejas desactivado entra aire "fresco" del exterior. Lo que si puede suceder es que el evaporador se puede obstruir de suciedad y pierda fuerza la salida del aire por el evaporador y tienen la sensacion de que el aire sale muy suave y se piensa que el el sistema esta malo. Si algun mecanico les ha dicho que el evaporador esta malo y tienen que cambiarlo es "paja" solo esta tapado y nesecita limpieza, los evaporadores son de aluminio y cuando tienen fisuras pierden el Gas R134 o en modelos mas viejitos R12 y es cuando no hay enfriamiento. Si les dice el evaporador esta malo solo pregunten por una prueba de presion de gas y veran si el sistema esta cargado NO HAY FUGAS. Otra cosa es tambien cuando el condensador esta sucio y cuando el compresor "comprime el gas" y lo manda al condensador para enfriarlo nesecita estar lo mas limpio posible para hacer su ciclo. Ese lo limpias comprando un galon en Vidri de acido para limpiar condesadores de Aire Acondicionado lo aplicas rociandolo y luego esperas unos segundos y limpias lo residuos con agua y veran el panal como nuevo.
EDIT: EL CONDENSADOR ES EL PANAL QUE ESTA SITUADO AL FRENTE DEL RADIADOR.